- "Baltic-Schule" Toitenwinkel, Integrierte Gesamtschule
- "ecolea" - Internationale Schule Rostock
- "Grundschule an den Weiden" Rostock-Toitenwinkel
- "St. Michael-Schule"
- "Warnowschule" Rostock, Schule zur individuellen Lebensbewältigung
- "Werner-Lindemann-Grundschule"
- Abendgymnasium
- Christophorusgymnasium - CJD Christophorusschule mit Grundschule
- Don-Bosco-Schule - Katholische Kooperative Gesamtschule mit Grundschule
- Erasmus-Gymnasium
- Evangelische Grundschule
- Förderschule für Körperbehinderte mit Grundschule "Paul-Friedrich-Scheel"
- Förderzentrum am Wasserturm, Schule für Erziehungsschwierige
- Friedensreich Hundertwasser, Integrierte Gesamtschule
- Gehlsdorfer Grundschule
- Grundschule "Am Mühlenteich"
- Grundschule "Am Taklerring"
- Grundschule "Heinrich Heine"
- Grundschule "John Brinckman"
- Grundschule "Juri-Gagarin"
- Grundschule "Kinderkunstakademie"
- Grundschule "Kleine Birke"
- Grundschule "Lütt Matten"
- Grundschule "Ostseekinder"
- Grundschule "Rudolf Tarnow"
- Grundschule "St.-Georg- Schule"
- Grundschule "Türmchenschule" Reutershagen
- Grundschule am Margaretenplatz
- Grundschule Schmarl
- Gymnasium Reutershagen
- Innerstädtisches Gymnasium
- Integrierte Gesamtschule "Borwinschule"
- Jenaplanschule "Peter Petersen", Integrierte Gesamtschule mit Grundschule
- Käthe-Kollwitz-Gymnasium
- Kooperative Gesamtschule Südstadt
- Krusenstern-Gesamtschule, Integrierte Gesamtschule mit Regionaler Schule im Aufbau
- Privatschule Universitas
- Regionale Schule "Ehm Welk"
- Regionale Schule "Heinrich-Schütz-Schule"
- Regionale Schule "Nordlicht-Schule"
- Regionale Schule "Otto-Lilienthal-Schule"
- Regionale Schule "Störtebeker-Schule"
- Schulcampus Rostock-Evershagen
- Schule für Kranke "Heinrich-Hoffmann-Schule"
- Sonderpädagogisches Förderzentrum am Schwanenteich, Allgemeine Förderschule
- Sonderpädagogisches Förderzentrum an der Danziger Straße, Allgemeine Förderschule
- Sonderpädagogisches Förderzentrum Toitenwinkel, Allgemeine Förderschule
- Sprachheilpädagogisches Förderzentrum
- Waldorfschule
- Werkstattschule in Rostock
